يُعد مختبر السوق المالي أحد المرافق التطبيقية المهمة في البرنامج، وقد أُنشئ عام 2006 بدعم من سوق فلسطين للأوراق المالية. يتيح المختبر للطلبة متابعة الأخبار الاقتصادية المحلية والعالمية، والتعرف إلى آليات التداول والاستثمار، وتطبيق مفاهيم التحليل المالي وإدارة المحافظ في بيئة تعليمية عملية. كما يستخدم المختبر في أنشطة محاكاة التداول والتدريب العملي، بما يعزز قدرة الطلبة على الربط بين المعرفة النظرية ومتطلبات الواقع المهني.