تنطلق رسالة قسم الجغرافيا من حرصها على تزويد الطلبة بالمعارف والمهارات، وتقوية قدراتهم على فهم ‏الظواهر الجغرافية ‏‏وتحليلها، ووضع الحلول للمشاكل التي تعاني منها فلسطين، مثل التلوث البيئي، والتغير ‏المناخي. كما يعمل القسم على تزويد الطلبة ‏‏بمهارات استخدام الأدوات والأجهزة والبرامج المحوسبة الحديثة ‏في بناء قواعد البيانات وإدارتها وتحليلها، والتخطيط المكاني ‏‏للمشاريع التنموية. ويركز قسم الجغرافيا في ‏على أربع محاور رئيسية وهي: الجغرافيا البشرية التي تركز على تفاعل البشر مع ‏‏بيئتهم، والجغرافيا الطبيعية ‏التي تركز على الخصائص الفيزيائية للأرض، والجغرافيا الاقتصادية التي تنظر في توزيع الموارد المائية ‏‏‏والنقل والصناعة، والجغرافيا التطبيقية التي تركز على المهارات العملية لتحليل الخريطة بشكل يدوي.‏

ويتطلع قسم الجغرافيا الى طرح برنامج ماجستير في التكنولوجيا الجيولوجية والذي من خلاله يستطيع طلبة ‏الأقسام الأخرى مثل قسم ‏‏تكنولوجيا المعلومات وقسم العلوم الالتحاق والتسجيل فيه، ويهتم القسم أيضا ‏بتدريب طلبته عمليا من خلال تحليل الخرائط يدويا ‏‏وتنظيم رحلات ميدانية في فلسطين والأردن.‏